在此之前，明朝构建海陆两大防线对抗后金，关宁防线抵挡后金正面进攻；登莱及辽东海上防线，威胁对手背后。
“登莱之乱”后，明军虽然收复胶东失地，但元气大伤，登州作为辽东前线的后勤基地的作用大大降低。
此后数年，鞑子有“三顺王”效劳，大明辽东诸岛相继失陷，海上防线基本瓦解。
消除后顾之忧的后金，可以集中全力，从正面进攻关宁，这也为崇祯后期松锦大战的结局又埋下了伏笔。
再者，孔有德率领成建制的军队投降，也开启了明末清初的投降潮。此前投降者，大多实力有限，尚未形成风气。而此后数十年间，统领大军而归顺清朝者，比比皆是。
从以上意义来看，“登莱之乱”很大程度上，影响了明末清初的历史走向。
李自成没有多少登州前线的最新消息，要是仍然按原历史线发展。孔有德坚持不了多久了。
实在说，前去围剿的什么天津总兵、通州总兵、蓟门总兵、昌平总兵、东江总兵、登州总兵、义勇总兵等等带的队伍都没啥战斗力。
战局变化就是从关宁军到达之后。
叛军野战失利，龟缩进登州府城，明军一时半会儿也攻不进去。
登州早先是大明的抗倭最前线，加强其军事能力是首要任务。后来鞑子崛起，登州的作用仍然十分大。
首先登州，莱州地区，作为山东向黄海延伸的一部分，为山东一省的海防前哨，山东有作为京师地区的屏障，所以登莱地区对拱卫京师的重要性不言而喻。
第二，登州地区与辽东半岛南部，高丽半岛隔海相望，一旦这两方面出现状况，登州地区可以在军事上起到牵制作用，同时利用海运为在高丽，辽东作战的军队提供后勤保障。
万历年抗倭援朝，向前线运送的物资总数，其中大部由登州发运。还有明军的三分之一，4万人，也有登州发运。
登州府“僻在东陲，三面距海，利擅鱼盐。且北指旅顺，则扼辽左之咽喉，南出成山，则控江、淮之门户，形险未可轻也。”
说明了登莱地区的地理位置举足轻重。
当辽东地区战事再起，于登、莱二府设立一位巡抚，便成为必然。
天启元年，毛文龙率二百人深入敌后，收复了镇江、广鹿岛、海洋等沿海岛屿，成功在后金军的后方开辟第二战场。为配合毛文龙部的行动，明廷下令：“登莱巡抚陶朗先发水兵一万人，由沈有容主之，天津巡抚毕自严调浙江水兵八千为后劲”。同时解军饷十二万由登莱转运。
可是“经抚各镇观望不前，以致失机”。虽然明廷失去了一次收复失地的天赐良机，但是这次不成功的军事行动，却说明了东江各岛，与登莱地区联系之密切。
毛文龙至皮岛开东江镇后，同样归属登莱巡抚节制。当然，与山东半岛的辖区相比，东江各岛在毛文龙死前都具有很强的独立性，登莱巡抚对东江军主要以核实兵饷，和转运军需物资为主。
崇祯二年毛文龙死后，东江划为四协，随后刘兴治发动兵变，杀陈继盛，登莱巡抚孙元化推荐黄龙出镇皮岛，东江各地与登莱巡抚的隶属关系才更加紧密。
还有，崇祯皇帝对袁崇焕真不错，为了给他统一事权，裁撤了登莱巡抚。而且登莱总兵也改为协将（副总兵），又裁撤部分士兵。
袁崇焕又在宁远设立了东江转运司负责对东江军的物资转运。“禁登莱商船入市”另一方面，袁崇焕的措施，导致了东江各岛都陷入了饥荒，于是有了双岛之变，毛文龙被杀，东江镇分为四协，以陈继盛统领。
袁崇焕死后，尤其皮岛兵变，朝廷才重新设立登莱巡抚，以孙元化担任。
孙元化接到任命后，鉴于登莱地区“兵马器械钱粮一物不备，虽备不精，不可以渡旅（顺）”，力主辞职，并要求朝廷给予足够的兵力，并以西洋大炮增援登州。
朝廷同意了孙元化的请求。
并且，毛文龙死后，其部下孔有德、李九成等人也率部渡海来到登州地区。
总之，登州地区可以说是城高池深、兵精粮足、火炮犀利，啥都不缺。而且还有海路可以通外面。
所以，孔有德龟缩之后，明军也只能采取围困之法。
九月份，明军各路俱至登州开始围城。
登州三面环山，北面向海，明军乃构筑一道长达三十里之围墙，其高如城，东西两端俱抵海。
由陈洪范、刘泽清率步兵守西墙，吴襄、靳国臣等率骑兵接应；
刘良佐、邓玘等率步兵守南墙，金国奇、祖大弼等率骑兵接应；
牟文绶等率步兵守东墙，祖宽、张韬等率骑兵接应。
因为这次有李自成这个异端，前面朝廷认为叛军已经是瓮中之鳖，于是提前抽调邓玘的川军去剿短毛。
由此带来的变化李自成还不清楚，比如李九成有没有像原历史线一样突围失败被打死？
而且十几天的后的正月份，监军宦官高起潜会在挂榜山（今蓬莱城南）新筑铳城，并用红夷大炮轰击城内，效果不错。明廷于是决定自京城再赶运更多的大炮。
当时，围城明军筑甬道运兵，甬道和城墙一样高度。昼夜不停地修筑了半个多月，双方展开激烈争夺战，最后甬道攻城失败。
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