在失立山，守备部队包括工程兵部队共约4600人，其中主力是日本海军陆战队的精锐部队，战斗力很强。配备203毫米、140毫米、80毫米火炮。柴崎采取滩头防御，在海滩上布置了障碍物、铁丝网和栅栏，防御工事用树木和珊瑚砂覆盖，有的用混凝土和钢板加固。所有火炮掩体均用钢板和厚珊瑚砂石覆盖，只有以406毫米重炮发射延时引信炮弹直接命中才能摧毁。
全岛工事经过长达十五个月的施工，形成了完备的防御体系，柴崎因此夸口，“就是用一百万人花一百年也攻不下失立山”。
小值贺岛的防御相对比较薄弱，包括工程兵部队和基地勤务人员，总共约690人，其中受过正规战斗训练的很少，仅240余人。在宇久岛日军刚开始设防，在中华帝国发动战争时，只有海军观通站，守备兵力仅25人。
尽管日军地面防御工事完备，但海空力量几乎没有。整个群岛没有一艘军舰，航空兵只有四架水上飞机。
中华帝国军参加对九州岛登陆作战的部队是由海军中将杨用霖指挥的第一特混舰队，投入作战的各种舰船约230艘，其中舰空母舰27艘、战列舰22艘、巡洋舰44艘、驱逐舰98艘、大型登陆舰船57艘，海军医院船7艘。作战飞机约1300架，其中猫妖、飞鹰、翼龙等舰载机920架，岸基飞机中H1N1“禽流感”轰炸机约700架。海军陆战队第2师和陆军第27步兵师调归第一特混舰队，准备用于福江群岛登陆作战。还将两个海军陆战队守备营和一个陆军守备营调归第一特混舰队，准备担负攻占岛屿后的守备任务。上述地面作战部队编为第5两栖军，由霍兰?任永清少将任军长，分别集结于蔚山、釜山、金海等地备战。
参战部队由第一特混舰队司令杨用霖统一指挥，航母战斗群负责压制日军在福江群岛附近岛屿的侦察机，以保障福江群岛登陆的顺利实施不被日本侦察机发现，并随时准备掩护登陆部队对日军防御工事进行轰炸和压制。担负在小值贺岛登陆的地面作战部队是第27步兵师，担负在失立山登陆的地面作战部队是海军陆战队第2师，他们都将得到航母战斗群的舰载飞机的支援。
另外，岸基航空兵组成航空联队，为登陆部队的海上航渡提供空中掩护，同时也担负对日本九州岛可能对福江群岛进行支援的部队实施打击和阻隔。
中华帝国军考虑到数百艘舰船在远离本土基地的海上将持续作战数周，为此中华帝国海军专门成立了为作战舰队服务的勤务船队，作为浮动的补给基地，也由杨用霖海军中将指挥，这支船队已拥有包括油船、供应舰、修理船、拖船、浮动船坞等各种辅助船只约20余艘，使得各种作战舰艇能够在靠近作战海域的地区得到急需的补给和修理维护。
从1913年初起，中华帝国军就已经开始了紧张的战前准备。先通过原先在福江群岛居住过的朝鲜人，了解水文、潮汐、地形等情况。从蔚山海军基地出发的潜艇利用在潜望镜上安装的照相机对对马岛失立山、小值贺岛和宇久岛进行了照相侦察，将三个主要岛屿的海岸线完整拍摄下来。通过航空侦察，发现日军失立山的防御重点都在堡礁外侧，决定舰队直接驶入礁湖，从堡礁内侧登陆。但最大的困难是失立山无规则的潮汐和遍地的珊瑚，由于登陆艇只能在大潮时靠岸，而直到年夏季，大潮都在夜间或黄昏，夜间登陆无法得到舰炮和飞机的支援，黄昏登陆又没有足够的时间在夜幕降临前巩固滩头。如果等到明年春季，日军的防御将更加坚固，所以中华帝国军最后决定在10月19日登陆，后推迟到20日早晨的小潮时刻登陆，由于中华帝国军不知道小潮高峰的确切时间，便将登陆时间定在8时30分。
从对佐世保的轰炸和西海反潜战开始，中华帝国军便开始了为即将开始的登陆作战做准备。叶祖贵的航母战斗群特混编队第1大队，在岸基航空兵的H1N1轰炸机协同下，于10月18日、19日对失立山和小值贺岛进行了空袭，迫使日军只在小值贺岛留下4架水上飞机，将其余的侦察机飞机全部撤走。空袭中还对两岛进行了系统的航空摄影，此外日军在抗击中华帝国军空袭中将很多小口径火炮改为对空速射炮，给中华帝国空军造成一定的威胁，不过日军没有这方面的防空系统训练，所消耗的大量弹药，由于补给断绝也得不到补充，最终未能对中华帝国空军造成实质性威胁，仅仅有一架飞机被击伤。
日本海军西海舰队得知中华帝国军的行动后，舰队司令古贺少将亲率舰队前出至长门准备出击，后因中华帝国海军实在太过强大，他一点机会都没有，于是才返回濑户内海，掩护本州和四国对九州的物资补给运输。
早在中华帝国砺剑1912军事演习时，尽管中华帝国将美国和日本的观察员排除在外，但是日本和美国还是得知了中华帝国的军事实力。从那时开始，美国对华采取绥靖政策，日本则积极开始相关研究。
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